Schimpansen und Bonobos haben sich in der evolutionären Geschichte der großen Menschenaffen vergleichsweise erst kürzlich getrennt. Sie spalteten sich vor etwa 1,7 Millionen Jahren in verschiedene Arten auf. Einige Unterschiede zwischen den Linien von Schimpansen (Pan troglodytes) und Bonobos (Pan paniscus) wurden durch einen kürzlichen Fortschritt in der Genomik der Hominiden deutlicher gemacht. Ein neues Bonobo-Genom wurde mit einem Multiplattform-Ansatz konstruiert, ohne auf Referenzgenome zurückzugreifen. Dies ermöglicht Wissenschaftlern einen genaueren Vergleich des Bonobo-Genoms mit dem von anderen großen Menschenaffen wie Gorilla, Orang-Utan, Schimpanse sowie dem modernen Menschen.
In einer Nature-Veröffentlichung vom 5. Mai erklären Forscher, wie sie das neue Bonobo-Genom entwickelt und analysiert haben und was der Vergleich mit anderen großen Menschenaffen-Genomen enthüllt. Das multinationale Projekt wurde von Yafei Mao von der Abteilung für Genomwissenschaften an der School of Medicine der University of Washington in Seattle und Claudia R. Catacchio von der Abteilung für Biologie an der Universität Bari in Italien geleitet. Die leitenden Wissenschaftler waren Evan Eichler, Professor für Genomwissenschaften an der School of Medicine der UW, und Mario Ventura von der Universität Bari.
Beim Vergleich des Bonobo-Genoms mit dem anderer großer Menschenaffen fanden die Forscher über 5.571 strukturelle Varianten, die die Bonobo- und Schimpansenlinien unterscheiden. Die Genomvergleiche ermöglichen auch neue Erkenntnisse darüber, was mit den verschiedenen Affengenomen während und nach der Abspaltung in verschiedene Arten von einem gemeinsamen Vorfahren passiert ist. Die Forscher waren insbesondere an dem interessiert, was als unvollständige Linien-Sortierung bezeichnet wird, um die Genetikevolution und die genetischen Beziehungen unter den heutigen Hominiden zu klären.
Die Wissenschaftler schätzten, dass 2,52% des menschlichen Genoms enger mit dem Bonobo-Genom als mit dem Schimpansen-Genom und 2,55% des menschlichen Genoms enger mit dem Schimpansen-Genom als mit dem Bonobo-Genom verwandt sind. Die Gesamtproportion basierend auf der Analyse der unvollständigen Linien-Sortierung (5,07%) ist fast doppelt so hoch wie frühere Schätzungen (3,1%). Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse des National Institutes of Health und weiteren Institutionen finanziert.
Das neue Bonobo-Genom-Assembly trägt den Namen der Weibchen, dessen DNA sequenziert wurde, Mhudiblu, ein derzeitiger Bewohner des Zoos Wuppertal in Deutschland. Die Forscher schätzen, dass die Sequenzgenauigkeit der neuen Montage bei etwa 99,97% bis 99,99% liegt und etwa 99,5% der 108.390 Lücken in der vorherigen Bonobo-Montage geschlossen wurden. Dies ermöglicht systematischere Vergleiche zwischen Menschen, Schimpansen, Gorillas und Orang-Utans ohne die Beschränkungen früherer Referenzgenomsequenzierungen.
